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一、初发患者为初次发病，可分为原发及非原发两种。
（一）原发患者既往无单纯疱疹的病史，血清中无HSV抗体。HSV后，临床表现重。患者是与有活动性单纯疱疹损害者发生性接触后发病的。潜伏期3～14天，平均6天左右。男性好发在龟头、冠状沟、包皮、；女性好发在外阴、宫颈、肛周及臀部，出现多数粟粒大、水疱，可彼此融合成片。2～4天后破溃成为糜烂或溃疡，自觉灼痒、疼痛。损害侵及尿道上皮时患者出现尿痛、排尿困难、尿道口有黏液性分泌物。侵及宫颈上皮时，宫颈糜烂、溃疡、白带增多。患者腹股沟淋巴结肿大、压痛，但不会发生化脓及破溃。发病1周内不时有新皮疹出现，7～10天时皮损达到高峰，之后逐渐消退结痂，一般需18～21天皮损完全消退，正常上皮长出。部分病例在发病的第1周可出现发热、、恶心、畏光，甚至颈部僵直等病毒血症乃至脑膜刺激。
（二）非原发患者初次出现生殖器疱疹的临床表现，但以往曾有口唇部单纯疱疹的病史。血清中有HSV-1抗体。由于HSV-1抗体对机体的保护作用，非原发性生殖器疱疹的临床表现较原发性生殖器疱疹要轻，皮损限局，病程亦轻，一般在2周左右皮损完全结痂脱落。患者一般无全身，腹股沟淋巴结亦不肿大。
二、复发首次复发多出现在原发性消退后半年至1年。复发次数平均3～4次/年，超过6次/年者为频繁复发。复发诱因有免疫功能下降和非免疫因素和疲劳、精神紧张、外伤、月经及其它等。一般男性较女性复发多见，但女性复发后的较男性重。临床表现和复发次数因人而异。
1．复发前数小时至1～2天常有先驱，如局部灼热、感觉异常或刺痛等，个别有向臀部，股部的放射性疼痛。
2．患者的外阴部出现、水疱，与原发性比较损害限局，数量亦少。破溃后成点状糜烂或浅溃疡。
3．一般4～5天后结痂，10天左右皮损痊愈。
4．患者腹股沟淋巴结不肿大，亦不出现全身；外阴部复发性损害同时侵及宫颈的也较原发性时要少得多。
三、免疫缺陷及HIV由于恶性肿瘤、器官移植等原因长期使用免疫抑制剂，致使机体免疫功能低下或有免疫缺陷者生殖器疱疹后，局部皮损重，病程长。可发生病毒血症，出现发热、、恶心、畏光等全身性不适，皮疹可泛发。
HIV者常发生严重的HSV，患者的外阴部及肛周可出现大片状的水疱、糜烂及溃疡。皮损可持续数月，在溃疡基础上常继发或。患者临床表现的严重程度取决于患者免疫缺陷的程度。资料表明，生殖器疱疹与HIV的流行有关。首先生殖器疱疹时外阴部的溃疡为HIV的入侵打开了大门，其次HSV时外阴部有多数浸润的淋巴细胞，它们是HIV侵入机体后的靶细胞，因此有活动性生殖器疱疹损害者较易上HIV。
四、男性同性恋通过，有活动性生殖器疱疹的一方可造成另一方发生单纯疱疹性直肠炎。急性发作，患者有严重的肛门直肠疼痛，肛门有血性或黏液性的分泌物，并有里急后重感。患者可有发热、周身不适、等全身。约半数患者肛周有水疱或溃疡。
五、妊娠期妊娠期与非妊娠期生殖器疱疹的临床表现相似，但孕妇HSV后对胎儿有影响。妊娠早期HSV可引起流产、早产、死胎。在分娩时新生儿可在经过产道或羊膜早破时上HSV，轻者无，重者发生播散性HSV，病死率很高，在妊娠期间患原发性生殖器疱疹的孕妇因病毒血症将HSV通过胎盘传染给胎儿的可能性很小。但分娩时经产道传染给胎儿的机会有20%～50%，这是因为患者的宫颈上皮不时有HSV脱落，使产道中常有HSV。妊娠期间生殖器疱疹易复发，复发性疱疹对胎儿的影响小，分娩时经产道传染给胎儿的可能性也小，仅3%～5%。
六、亚临床指无生殖器疱疹临床表现的HSV者。实际上血清HSV-2抗体阳性者大多数并没有出现过可辨识的生殖器疱疹损害，仅20%曾有典型损害，还有20%为无的亚临床。对原发性生殖器疱疹的女性患者作定期随访，取宫颈分泌物作病毒培养，经常出现阳性结果，这说明虽然临床上无生殖器疱疹的表现，但疱疹病毒却寄居在宫颈上皮细胞内，并不断脱落下来。这种处于亚临床的病毒携带者由于生殖道的皮肤黏膜能排出病毒，成为疾病的一个重要传染原。
